incertae sedisː
Zygomycota es una división parafilética de hongos, que incluye alrededor de 1000 especies. Los hongos pertenecientes a la división Zygomycota se caracterizan por formar zygosporas con gruesas paredes, de origen sexual y esporangiósporas no nadadoras, de origen asexual. El moho negro del pan (Rhizopus nigricans), un representante bien conocido de este grupo del orden Mucorales, produce masas de hifas sobre pan, fruta y otros alimentos deteriorados. El cuerpo de este hongo, compuesto de hifas no septadas (cenocíticas), muestra que a pesar de una pequeña diferenciación celular entre los hongos, las hifas pueden especializarse por varios propósitos. Los hongos del orden Entomophthorales son parásitos de las moscas, protisas miniaturas y de otros insectos. Son organismos de nutrición saprofita, se alimentan de restos de plantas y animales del suelo. Tienen esporangiósporas sencillas dentro de unos receptáculos; en el interior de cada uno de ellos se desarrollan unas estructuras que llegan a independizarse y funcionar como conidios. El orden Zoopagales comprende hongos parásitos de amebas, nemátodos y artrópodos. Los miembros de este orden tienen parecido con los ascomicetos ya que ambos grupos comparten el mismo núcleo, pero no están evolutivamente emparentados.
Estos tipos de hongos producen esporas asexuales dentro de los esporangios, y durante la reproducción sexual se forma una zygospora con paredes resistentes, en la que ocurre la meiosis.
La mayoría de los hongos conocidos como moho, como los del pan o la fruta, pertenecen a esta división.
Zygomycota es un grado o grupo parafilético que representa la etapa más temprana de la evolución del clado Amastigomycota. Su filogenia lo divide en dos linajes diferentes:
Debido a que es un taxón parafilético se ha propuesto dividir a Zygomycota en dos divisiones diferentes Zoopagomycota y Mucoromycota.
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