La fauna de Venezuela consiste en una gran variedad de animales únicos. Venezuela cuenta con manatíes, delfines y cocodrilos en el río negro y orinoco. Venezuela acoge un total de 1420 especies de aves, 48 de las cuales son endémicas. Pájaros importantes incluyen ibis, águilas pescadoras, martín pescador y el amarillo-naranja, el turpial (ave nacional). Mamíferos notables incluyen el oso hormiguero gigante, el jaguar, el mono aullador y el capibara (H. hydrochaeris), el roedor más grande del mundo. Más de la mitad de las especies de aves y mamíferos venezolanos se encuentran en los bosques amazónicos al sur del Orinoco. Venezuela está entre los 17 países más megadiversos del mundo. Los países megadiversos son un grupo de países que albergan el mayor índice de biodiversidad de todo el planeta.Venezuela se encuentra entre los 10 países más biodiversos del planeta según National Geographic.
Venezuela posee un gran número de insectos que abarca un total de más de 200.000 especies que se agrupan en coleópteros (escarabajos), Orthoptera (grillos), Formicidae (hormigas), Odonata (libelulas), Hemiptera (chinches, pulgones), Arachnida (arañas, escorpiones) y muchos otros. Venezuela también posee en su territorio un gran número de crustáceos, moluscos y porifera (esponjas).
En mariposas, Venezuela posee unas 3.000 especies siendo uno de los países con más variedad en todo el mundo.
La avifauna de Venezuela es muy diversa e incluye un total de 1420 especies, de las cuales 48 son endémicas, 6 han sido introducidas por humanos y 34 son consideradas raras o accidentales. Se han declarado 33 especies globalmente amenazadas de extinción. Algunos especialistas revelaron una estimación de más de 1.500 especies de aves registradas en Venezuela convirtiendo al país en uno de los 5 con más especies de aves en el mundo.
Venezuela es un país con un territorio extenso y con gran variedad de climas, por lo que presenta una gran lista de aves, algunas que se refugian en la frondosidad de la selva tropical y Los Andes, otras en los Llanos, costas y lagos, incluyendo el Lago de Maracaibo. Esto se debe a que la extensa geografía se traduce en 9 regiones naturales, que hacen del país uno de los más diversos geográficamente y que contribuye significativamente a la diversidad global.
Existen variadas fuentes que determinan distinto número de especies de aves presentes en Venezuela que se encuentran amenazadas a nivel mundial.
Según algunas fuentes, son 370 de las especies de animales existentes en Venezuela que se encuentran amenazadas a nivel mundial, mayoritariamente aves (130 especies). Seis de ellas, incluyendo dos aves, el águila arpía y el cardenalito, han sido incorporadas en los billetes venezolanos con las principales causas que los ponen peligro de extinción.
En Venezuela hay unas 400 especies de mamíferos, de las cuales una se encuentra en la categoría de críticamente amenazada, hay seis mamíferos amenazados, diecinueve identificados como vulnerables y cuatro casi amenazados. Venezuela se encuentra entre los 15 países del mundo con más especies de mamíferos.
Venezuela cuenta con aproximadamente 2000 especies de peces marinos y un aproximado de 1300 especies de peces de agua dulce. Venezuela es el 4° país del mundo con más especies de peces de agua dulce.
La lista de reptiles en Venezuela, incluye a 405 especies de reptiles registrados en Venezuela. El listado se basa en la base de datos de The Reptile Database. Los reptiles de Venezuela se agrupan en 3 órdenes y 30 familias, e incluyen serpientes, lagartos, cocodrilos y tortugas.
La lista incluye un total de aproximadamente 400 especies de anfibios registradas, Venezuela es el 9° país con más especies de anfibios en el mundo.
Con respecto a la fauna en el parque habitan numerosas especies de avifauna, aproximadamente 266, reportadas para el Refugio de Fauna Silvestre Cuare. Debido a que el parque nacional Morrocoy y el Refugio de Fauna Silvestre Cuare se encuentran ubicados en una misma área geográfica, se infiere que para el parque debe existir un número similar, entre las que se destacan el águila pescadora, especies vulnerables como el flamingo, la garza paleta, el pelícano especie de la avifauna cuyo hábitat preferido es la vegetación de manglar donde anida y reposa, cotúa, garcita blanca, el paují de copete, el loro real Amazona, la corocoro, la garza pechiblanca y las especies consideradas de distribución restringida como la fragata o tijereta de mar. Los manglares de la Bahía de Morrocoy son excelentes refugios de aves; sobre todo en la isla de Pájaros, que es un cayo cubierto de manglar ubicado en la zona central del parque.
Habitan además numerosos reptiles marinos, entre los que se destacan las tortugas marinas como la tortuga verde, la tortuga carey, la tortuga cardón, la tortuga cabezón así como el caimán de la costa, todas ellas consideradas por el libro rojo en peligro de extinción. Entre los mamíferos se incluyen tanto los mamíferos marinos (delfines, ballenatos) que utilizan el parque como refugio así como las diferentes especies de mamíferos terrestres, que se localizan mayoritariamente en el Cerro Chichiriviche, entre los que se pueden mencionar el venado matacán y el venado caramerudo, el oso melero, el zorro cangrejero, el mono araguato, la pereza, el rabipelado, la lapa, el picure y el báquiro cinchado. Los peces que se reproducen en el parque son el mero, mixines, pargo, curbina, sábalo, róbalo, el pez sapo, cazón, sardina, el jurel, el corocoro, la picúa, la cachama negra, así como peces que habitan en los arrecifes coralinos. Entre los moluscos y crustáceos: la ostra de mangle, liebres marinas, quigua, existen 2 tipos de langostas Panulirus argus -Panulirus guttatus, cangrejos azules y rojos, jaibas, entre otras especies. Existe una variedad diversa de insectos, aunque aún no existe un levantamiento de información para la zona.
Debido a las condiciones ambientales extremas y la carencia de agua dulce, los animales terrestres no abundan. La lista se limita a algunas especies de iguanas y lagartijas, arañas e insectos. El murciélago pescador (Noctilio leporinus) es el único mamífero terrestre autóctono.
Es en el agua donde la inmensa riqueza se vuelve evidente: 280 especies de peces, 200 especies de crustáceos, 140 especies de moluscos, 61 especies de corales, 60 especies de esponjas y 45 especies de erizos y estrellas de mar. Abundan los delfines, ballenas, mantarrayas y tortugas.
Los animales más representativos son la tortuga verde (Chelonia mydas), el botuto o caracol reina rosado (Strombus gigas), la langosta espinosa (Panulirus argus), peces típicos de los arrecifes de coral y 92 especies de aves. Los Roques es punto de encuentro de unas 50 especies de aves migratorias de América del Norte. Entre las aves más frecuentes está el pelícano pardo (Pelecanus occidentalis), dos especies de pájaro bobo, el de patas coloradas (Sula sula) y el piquero café (Sula leucogaster) y la gaviota guanaguanare (Larus atricilla). También suelen observarse algunos grupos de flamencos (Phoenicopterus ruber).
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